顾名思义,《变形金刚:赛博坦大战》的主题是狂派(Decepticons)与博派(Autobots)的变形金刚在母星赛博坦展开的战争,这场变型金刚内部的纷争是日后大战的开端。这次的《变形金刚:赛博坦大战》在系统面作了大幅的翻新,血统更接近纯正的第三人称射击;游戏的操作与一般FPS/TPS无异,左类比杆移动、右类比杆瞄准,左右发射键可分别进行瞄准与射击,另外还有投掷手榴弹、肉搏攻击等变化。变形金刚可携带两种武器,在战场上能随时捡拾新兵器替换,还可以把固定炮座拆下来带着跑。
《变形金刚:赛博坦大战》交代了密卡登如何夺取Dark Energon而崛起,以及柯博文(Optimus Prime)成为「Prime(至尊)」的经过。
威力强大的炮座可以拆下来带着走。