总共6项基本技能，但指挥官只能学到其中的4项，且与四代的英雄技能一样，指挥官的基本技能也有五级：基础、高级、专家、大师、宗师。当两项基本技能都学到了大师级之后，就可以学习这两项基本技能所对应的特殊技能，所以具体学哪四项不仅仅要考虑该基本技能本身的功效，还必须考虑它引出的特殊技能是否实用。
一般而言，指挥官都是以肉盾的形象出现的，所以防御是必须要学的，生命最好也学，但并非必需；魔法是BT地图上的裸奔指挥官必备的，否则命再长也就值那么几个爆裂，另外对于收魂使者这一辅助型兵种来说，魔法技能增加施法（聚灵）次数更加重要；速度虽然也很重要，但由于它所引出的特技没有一个实用的，所以最好不要学，给指挥官找双鞋子就行了。
推荐技能：1、防命伤魔（BT地图裸奔首选）；2、攻防命伤；3、攻防伤魔。
3.58版中依靠技能树、秘银、力量之石、斯拉瓦的力量之戒等的帮助可以轻易培养出具备6项基本技能的全能英雄，所以升级时选择技能也不必太过刻意了。
| 指挥官基本技能 | |
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攻击（Attack） 基本作用：增强指挥官的攻击。 没有：指挥官攻击为5 基础：指挥官攻击达到7 高级：指挥官攻击达到10 专家：指挥官攻击达到14 大师：指挥官攻击达到20 宗师：指挥官攻击达到30 |
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防御（Defense） 基本作用：增强指挥官的防御。 没有：指挥官防御为5 基础：指挥官防御达到9 高级：指挥官防御达到15 专家：指挥官防御达到23 大师：指挥官防御达到35 宗师：指挥官防御达到55 |
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生命（Hit Point） 基本作用：增加指挥官的生命。 没有：指挥官生命为20＋指挥官LV×20 基础：指挥官生命增加10％ 高级：指挥官生命增加25％ 专家：指挥官生命增加45％ 大师：指挥官生命增加70％ 宗师：指挥官生命增加100％ |
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伤害（Damage） 基本作用：增强指挥官的伤害。 没有：指挥官最大伤害为8＋指挥官LV×4，最小伤害为最大伤害的一半 基础：指挥官伤害增加10％ 高级：指挥官伤害增加25％ 专家：指挥官伤害增加45％ 大师：指挥官伤害增加70％ 宗师：指挥官伤害增加100％ |
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魔法（Magic Power） 基本作用：增加指挥官的魔法力量与施法次数并增强指挥官的抗魔能力。该抗魔属性只对攻击魔法有效，且类似于H4的抗魔技能，即只能减少伤害，不能躲避魔法 没有：指挥官力量为1，施法次数为1，抗魔5％ 基础：指挥官力量达到2，施法次数达到2，抗魔10％ 高级：指挥官力量达到4，施法次数达到3，抗魔20％ 专家：指挥官力量达到7，施法次数达到4，抗魔40％ 大师：指挥官力量达到15，施法次数达到5，抗魔65％ 宗师：指挥官力量达到30，施法次数达到6，抗魔95％ |
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速度（Speed） 基本作用：增加指挥官的速度。 没有：指挥官速度为4 基础：指挥官速度达到5 高级：指挥官速度达到6 专家：指挥官速度达到7 大师：指挥官速度达到8 宗师：指挥官速度达到10 |
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